Encadré par 7 professeurs spécialisés en musique baroque, l'orchestre du CMAS, sur instruments baroques, est destiné aux élèves à partir de la fin de cycle II qui jouent sur instruments anciens, au diapason 415. L'orchestre, constituté d'une trentaine de musiciens, prépare 2 programmes par an et invite régulièrement des solistes pour les concerts. Son répertoire parcourt les 17ème et 18ème siècles. Il s'est déjà produit en Allemagne, ainsi qu'à Reims et en Nouvelle-Aquitaine.